新しいSurface Pro 3のセットアップ時に初めて見るトラブルが起きたので紹介します。

Surfaceペンのペアリング時に、きちんとSurfaceペンに電池も入っていて、緑のライトも点滅しているにもかかわらずBluetoothデバイスとして認識されません。
画面下のほうに「接続できませんでした(3回中x回)。もう一度やり直してください。」と表示されます。

Surfaceペンのペアリング時に、きちんとSurfaceペンに電池も入っていて、緑のライトも点滅しているにもかかわらずBluetoothデバイスとして認識されません。
画面下のほうに「接続できませんでした(3回中x回)。もう一度やり直してください。」と表示されます。

3回目が終了すると、Surface Pro 3があきらめたようで「ペアリングが失敗しました。」と表示されてしまいます。
セットアップ後にPC設定からペアリングを試みましたが、うまくできませんでした。ほかのBluetoothマウスは認識することができたので、本体のBluetoothの問題でもなさそうだし...。
どのように解決したかというと、別の部屋に行きペアリングしただけでした。
実は近くというか同じ部屋にもう1台のSurface Pro 3が存在したのが問題だったようです。
Surfaceペンのペアリング後は、同じ部屋でも問題なくSurface Pro 3とSurfaceペンを使うことができました。
Surface Pro 3を複数台購入した場合には、SurfaceペンのペアリングはほかのSurface Pro 3とは離れた場所で行うようにしてみてください。